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人体肠道菌群被认为是最吸引人的微生物多样性宝库,含有400-1000种细菌种类归于9个门(包括硬壁菌门、拟杆菌门和放线菌门等等)。其中最有趣的一项是了解微生物各个小组中哪个在保持微生态平衡中起到活跃作用。
这里我们描述了具有活力的微生物部分并与全部群落相比较。我们用焦磷酸测序了4位健康志愿者的16S rDNA基因。各部分的获得采用基于菌体RNA浓度的细胞分选法。细菌家族中被应用于细胞分选法的表现或不表现通过RNA吡罗红y染色的活性细胞流式计数来评价。这一方法可以检测有活力的细菌,进而表明活力细菌作用不同于整个粪便所有细菌。
总体上,结果表明在活性部分中拟杆菌序列的数量减少,而硬壁菌科梭菌目中一些细菌家族很显著的出现。还有,细胞分选法分选出的许多细菌家族也是属于活性菌群的一部分,表明这些菌群被总的读序数所掩盖。
Peris-Bondia F, Latorre A, Artacho A, Moya A, D'Auria G.The active human gut microbiota differs from the total microbiota.PLoS One. 2011;6(7):e22448. Epub 2011 Jul 28.
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