进入我国市场的大量外企导致竞争加剧
     加入世界贸易组织WTO后，我国功能食品行业面临的国际竞争更加剧烈。以杜邦、佳得乐、帝斯曼等为代表的跨国企业加快了在我国的发展速度。这种压力和挑战也促使我国功能食品行业进入一个新时期。要取得国内乃至国际市场上的优势地位，我国生产企业就必须借鉴国外大型功能食品生产企业先进的生产工艺、功能因子提取技术等，加大我国功能食品生产企业的科研实力，提升产品的科技含金量，为我国功能食品走向国际市场打下基础。
为我国特色功能食品发展带来机遇
     加入WTO，也给我国有特色的以中药材为原料的功能食品走向世界提供了契机。开发以中药材为原料的功能食品可使我国丰富的中药材资源得以充分利用，提高产品附加值，打造我国特色品牌。
     我国以中药材为原料的功能食品发展目前面临着国际贸易壁垒的问题。例如，我国的功能食品在美国仅仅允许以普通食品的身份出现。这主要是由于我国对这类功能食品的开发虽然有中医药理论为基础，但缺乏对此类产品中功能因子的深入研究。这类功能食品要走出国门，必须加紧对功能因子构效和量效关系的研究工作。

加快核心技术知识产权保护的国际化
     我国加入WTO后，知识产权问题是其中的核心问题之一。进入我国的许多外企对核心技术强烈的知识产权保护意识也影响着我国的一些功能食品生产企业。
     我国功能食品生产企业对知识产权保护情况不容乐观。技术创新型企业的许多核心技术未进行知识产权保护，导致企业的技术创新产品被仿冒，致使企业更倾向于风险的跟进战略。我国功能食品生产企业对于自主研发的核心技术，在申请我国知识产权保护的同时，还须向美国、日本、欧盟等国家和地区申请国际知识产权保护。这样可以在未来竞争中占据优势。

促进我国科技人才培养和研发体系的建立和完善
     我国加入WTO后，大量国外功能食品生产企业进入我国，在使竞争加剧的同时，也促进了我国功能食品科技专业人才的培养。近年来，国外主要的食品企业纷纷在中国设立研发机构，这为我国食品专业技术人才提供了大量的学习机会。这些国外知名企业为我国食品专业技术人才提供了接近功能食品技术发展前沿的机会，有效弥补了我国现有人才培养体系的不足。
     同时，外企对我国食品专业技术人才所进行的的技术管理培训对我国食品工业的发展也起到了积极的作用。可以推测，随着国外大批研发中心的建立，这种作用将越来越大，成为推动我国食品科技发展的积极力量。
     我国加入WTO之后，与国际许多大型知名功能食品生产企业形成了互动。国外生产企业看重的是我国的资源和市场优势，我国可以学习的是国外生产企业的先进技术和管理模式。国外生产企业开放的科研开发体系为我国功能食品科研开发体系的建立起到了积极的借鉴意义。