本实验室由生物活性物质与功能食品研究室（下简称研究室）和保健食品功能检测中心（下简称中心）两个业务机构和一个管理日常工作的办公室组成。研究室下分三个研究方向：  保健（功能）食品安全与功能学 ； 生物活性物质的分析检测及制备技术 ； 天然产物化学和次生代谢物生物化学 。 中心是学院全资举办的自收自支的事业性法人单位，是卫生部认定的保健食品功能检测机构，其主要职能是接受企业委托对产品进行保健功能评价，研究保健食品新的功能评价体系，承担功能因子的检测及行业协会委托的市场监督等任务。中心作为实验室为社会服务的窗口，利于产、学、研结合，同时为实验室筹措日常运转经费，积累建设发展资金。
  业务领域  
                实验室业务定位，以生物活性分子的结构与功能的研究为基础，以功能食品的开发为主要应用领域，为我国功能食品的发展提供技术支持和服务。生物活性分子的结构与功能的基础和应用研究。
                                   * 　功能食品的功能因子的研究
                                   * 　功能食品的研发
                                   * 　功能食品的功能学、毒理学、功效成分测定
  技术实力  
            本实验室从 1985   年开始在国内开展功能食品的应用基础和开发研究。在保健食品功能因子（生物活性）的作用机理、保健食品基础性材料及新资源的开发、保健食品功能  学测定的原理和方法等领域开展了大量深入的研究和开发工作。在论证保健食品发展的科学依据，我国保健食品发展方向及功能学检测体系的建立等方面的工作及有关论著，在保健食品工业领域获得积极评价认可。该实验室集中了一批在生理字、营养学、生物化学、分子生物学、生物技术等方向训练有素的人才，为在该领域开展多学科的综合研究奠定了可持续发展的坚实基础。
  学术委员会  
          本实验室设置学术委员会，聘请了校内外 11 名专家，陈可冀院士出任主任委员 。学术委员会在实验室制定中长期发展规划、开展科学研究和学术交流等方面起着重要的咨询与指导作用。学术委员会的工作方式一是每年召开   1 ~ 2  次全体会议，讨论实验室建设中一些重大问题：如实验室五年建设规划、开放课题的设置等问题。根据实验室研究方向、学术交流等项工作与部分学术委员进行不定期的咨询及指导。
研究生培养  
              实验室已与北京大学医学部、首都医科大学、江西师范大学、北京师范大学、首都师范大学等全国 7 所高等院校合作培养了近 20   名研究生。